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L'image du mois
Cellules mastocytaires imagées au TIRF
Plateau technique d’Imagerie Cellulaire et Tissulaire de l’ICB/IFR02
Service de Microscopie Confocale
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Depuis Février 2011, le vidéomicroscope TIRF est installé sur le plateau d’imagerie cellulaire de l’Institut Claude Bernard.
La technique du TIRF nous permet de suivre des évènements se produisant à l’échelle de la membrane.
Grâce à cette nouvelle technique, nous atteignons une résolution de 100nm.
Acquisition avec TIRF 3 Zeiss avec un objectif X100, ON 1.43
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Dans des cellules mastocytaires en culture, nous avons marquées avec deux fluorochromes différents des protéines SNARE impliquées dans la fusion entre les membranes granulaires et la membrane plasmique afin d’étudier le phénomène de dégranulation. Nous pouvons constater la différence de résolution entre la vidéomicroscopie (à gauche) et le TIRF (à droite).
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Publication(s) du mois
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Un travail de recherche ayant utilisé le centre de biomodélisation de l’ICB-IFR02 vient de paraître dans le dernier numéro de Janvier de la revue Science : « The molecular diversity of adaptive convergence », 2012, 335, 457-461.
Ce travail, mené par Olivier Tenaillon de l’UMR S722 en collaboration avec une équipe de l’Université d’Irvine en Californie, montre en direct comment agit la sélection naturelle. Les auteurs ont pour cela fait évoluer 115 lignées d’une souche d’Escherichia coli pendant 2000 générations au laboratoire dans des conditions extrêmes, à 42,2°C, puis ont séquencé complètement les génomes de ces 115 lignées à la recherche de mutations. Ils ont mis en évidence 1331 mutations, touchant plus de 600 sites différents sur le génome. Peu de mutations ont été retrouvées partagées entre les lignées, mais par contre une forte empreinte de convergence a été retrouvée au niveau des gènes, des opérons et des complexes fonctionnels. En effet, les mutations ont été retrouvées à des nucléotides différents dans les mêmes gènes, les mêmes ensembles de gènes cotranscrits (les opérons) ou dans des gènes codants pour des protéines qui interagissent entre elles dans une même voie fonctionnelle. Ceci est un signe fort montrant que ces mutations ont été sélectionnées pendant l’évolution au laboratoire et ont permis aux lignées de s’adapter. Il est intéressant de noter que les mutations ont été identifiées dans des régulateurs globaux tels que l’ARN polymérase ou le facteur de terminaison de transcription Rho. Enfin, les auteurs ont montré que ces mutations avaient des associations préférentielles, indiquant la présence d’épistasie, c’est à dire d’interactions entre les mutations. L’adaptation se fait donc par des trajectoires génétiques différentes, mais qui touchent les mêmes fonctions.
Ce travail illustre l’utilité des méthodes de séquençages à haut débit qui génèrent de très nombreuses données de séquences permettant de puissantes analyses statistiques. |
Le plateau technique du mois
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Contact pour ICB-IFR2 :
UMR738 INSERM - Institut Claude Bernard
Faculté de Médecine Site Bichat
16 rue Henri Huchard 75018 Paris
fax : 33 (0)1 57 27 75 21
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Grâce à la persévérance de Thierry Grange et des personnels des 3 instituts (Institut Jacques Monod, Institut Cochin et Institut Claude Bernard) impliqués dans le projet depuis plus de 3 ans, notre communauté va disposer très prochainement de moyens propres de pré-séquençage, de séquençage moyen débit et d’analyse des données ainsi produites. Cet outil qui vient combler un gap important entre les moyens parfois un peu limités de chaque site et les grandes infrastructures nationales devrait rencontrer un succès important. L’ICB-IFR2 se félicite de sa forte implication dans la réussite de ce projet......
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La vie des sites
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Hôpital |
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Site Bichat |
Site Villemin |
Beaujon |
Lariboisière |
Louis Mourier
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Robert Debré |
Saint Louis |
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Appel(s) à projet /appels d'offres du mois
Formation(s)
Emploi
Offre(s) |
Nantes : recrute chef de projet
L'institut du thorax et le CHU de Nantes souhaitent recruter un chef de projet translationnel qui aura pour mission de coordonner les projets de recherche à l'interface entre les équipes de recherche et les équipes cliniques de l'institut du thorax.
Offre poste chef de projet translationnel
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L'IGBMC (Illkirch/Strasbourg) recrute dans le cadre d'un CDD de 6 mois minimum, un contrôleur de gestion H/F
Ce contrat peut déboucher sur un poste stable.
Mission - Mise en place et suivi budgétaire des plateaux techniques
Lire le profil recherché (IGBMC)
Contact : emploi@igbmc.fr (référence IGBMC / CG-9)
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La plate-forme de protéomique fonctionnelle (UMS 3426 BioCampus, IGF, Montpellier) recrute un assistant-ingénieur débutant en biochimie sur CDD CNRS de 6 mois
Date de prise de fonction : mi-mai 2013
Mission - Réaliser les différentes étapes spécifiques de préparation des échantillons (gel d’électrophorèse SDS-PAGE, coloration, digestion, dessalage) en vue de leur analyse par spectrométrie de masse
Lire le profil recherché (PPF)
Contact : Martial Séveno |
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Actualités |
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Cinquantenaire de l'Inserm : appel à participation
L'Inserm célèbrera ses 50 ans en 2014.
Depuis sa création en 1964, tous les personnels des laboratoires et administrations de l'Inserm en ont bâti l'histoire. C'est donc votre participation qui fera de cet anniversaire un moment réussi. Pour contribuer à l'organisation de cet évènement dans votre région, vous être invités à vous inscrire dès à présent en ligne :
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Les mercredis de Bichat-Beaujon
séminaires hebdomadaires
Mercredi 22 mai 2013 - 13h
Mécanismes et conséquences pathologiques de la colonisation vasculaire par Neisseria meningitidis
par Guillaume Duménil
salle des thèses S-179, 1er sous-sol, Faculté de Médecine
Xavier Bichat
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Forum science, recherche & société - cultivons le futur
Le 23 mai 2013 au Collège de France (Paris 5e)
Table rondes, conférences, exposition de photos scientifiques, projection de documentaires... Le Forum science, Recherche & Société est un rendez-vous unique pour découvrir, comprendre et apporter sa contribution sur les sciences et les technologies au coeur de nos enjeux d'avenir. Venez y rencontrer des chercheurs de l'Inserm.
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Le cerveau à tous les âges
Jusqu'au 5 janvier 2014 à Poitiers
Pour se défaire des idées reçues sur le cerveau et les neurones, pour connaître leur physiologie et en savoir plus sur leur vieillissement, visitez l'exposition "Le cerveau à tous les âges", réalisée par l'Espace Mendès France et des chercheurs poitevins.
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Les mercredis de Bichat-Beaujon
séminaires hebdomadaires
Mercredi 22 mai 2013 - 13h
Mécanismes et conséquences pathologiques de la colonisation vasculaire par Neisseria meningitidis
par Guillaume Duménil
salle des thèses S-179, 1er sous-sol, Faculté de Médecine
Xavier Bichat
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Vient de paraitre
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Histoire de la procréationhumaine
Nouvelle édition revue et actualisée de la magistrale Histoire de la procréation naturelle et artificielle publiée en 1994 par Jacques Gonzalès, professeur de médecine, historien (Hôpital de la Salpétrière et chercheur à l'Unité Inserm Endocrinologie et Génétique de la reproduction et du développement, Clamart).
novembre 2012, 744 pages
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L'homme peut-il s'adapter à lui-même ? par Jean-François Toussaint, Bernard Swynghedauw, Gilles Boeuf - Cet ouvrage est un recueil des réflexions scientifiques les plus récentes pour tenter d’évaluer si l’homme peut encore s’adapter aux conséquences de ses propres agissements sur l’environnement et modérer sa soif du "toujours plus".
(Cirad, Ifremer, Inra, Irstea), octobre 2012, 192 p. |
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On en parlemission
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L'Inserm et l'Académie de Créteil engagés dans C.Génial
Le 17 avril 2013 a eu lieu la finale du concours C.Génial, à Champs-sur-Marne (Université de Marne-La-Vallée). Cet événement départageait les projets scientifiques de collégiens curieux et inventifs. L'Inserm était engagé à double titre. Certains de ses chercheurs étaient membres du jury. D'autres ont accueilli, en amont du concours, les élèves dans leur laboratoire, à l'I-STEM et au laboratoire "Hémostase et Dynamique Cellulaire Vasculaire". Ceci dans le cadre de la convention qui lie l'Inserm et l'Académie de Créteil pour C.Génial.
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Forum Labo
Du 4 au 7 juin 2013 venez rencontrer les professionnels du laboratoire regroupés Porte de Versaille à Paris.
Les services achats du CNRS, de l'Inra et de l'Inserm seront également présents sur leur stand "EPST". Deux forums experts dédiés aux marchés publics seront animés par ces services pendant le salon.
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usnous autoproclamons "société de la connaiss
Exprimez-vous ?
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